pues yo diria que ni mas ni menos, aunque hayas borrado todo lo relacionado, se te ha quedado algo de lo que compilaste y es lo que no te deja reinstalar correctamente.

Todo aquello que compilas desde linea de comandos y luego instalas con make install, la mayoria de las veces no borras todo a mano, ya que puede "repartir" las cosas por diferentes carpetas, a parte de la propia del programa...

La forma de desinstalar algo compilado, es metiendote en la misma carpeta desde donde hiciste make install y teclear make uninstall. Fíjate en la linea qu ehas usado para la compilacion, y ve entrando en los directorios donde entra el comando cd, y desde ahi haces make uninstall como root. Esto te dará errores, ya que llos has borrado a mano y no encontrará los archivos.

La solucion que se me ocurre es que desintales gimp y los paquetes compilados desde aptitude, apt-get o synaptic, lo que hayas usado, utilizando la opcion --purge, asi desinstalará el paquete y borrará todas sus configuraciones guardadas....
Respecto a lo compilado a mano, ejecuta el proceso que has hecho para la instalación, asi lo volverás a instalar. Luego, como te he dicho antes, entra en cada directorio usado para la compilacion y realiza el make uninstall como root. Para tu linea de arriba, seria:

Una vez limpio tu sistema, ya puedes instalar gimp normalmente desde synaptic o tu gestor de paquetes.

Para el caso de "downgradear" la versión de algun paquete, puedes mirar en synaptic mismo:
Busca el paquete en cuestion con synaptic, cuando lo encuentres, seleccionalo con un clic del raton mismo, luego vete arriba al menu "paquete" (package) (creo que lo pondrá asi, lo tengo en mi lengua materna y no sé si la traduccion sera esa) y ahi verás la opcion "forzar version". Con ésta podrás, mientras hayan varias disponibles, seleccionar que version quieres que se instale.

P.D.: Un consejo que nadie que no esté familiarizado con el uso de linux y consola sigue o tiene en cuenta, leer y releer antes de seguir tutoriales de la web, sea cual sea. Copiando y pegando pasan muchas cosas indeseadas, no todos los sistemas son iguales, aun cuando sea la misma version la que se esté usando.

El problema que tengo es que estas carpetas ya no estan. No se si el comando make la borra o no, la cosa es que si hago un "find" encuentro esto:

Eso es lo que hice antes. Borre todos los archivos que aparecian con gimp-2.7 pero no sé si habra tocado algun paquete más.

veo esto tambien pero no se si borrarlos de un tiron.

Bien, seguí tus pasos y luego busque por todo el pc.... muchisimos archivos desperdigados..mmmm me ha costado. Los borré todos a mano y conseguí instlar gimp 2.6. Resulta que en la compilacion modificó el archvios libgegl cuya version era igual a la instalada pero con modificaciones. La borré y fue todo como la seda al volver a instlar todos los paquetes de los que depende gimp. Espero que no falle mucho el pc por ( librerias compartidas).

Sin haberlo hecho yo, no me atrevería a decirte que borres o no...
vuelve a realizar la instalacion tal y como la hiciste. luego realiza lo que te dije sobre make uninstall
Será la mejor forma de asegurarte de borrar todo lo que se instala con e proceso que seguiste, luego realiza la purga desde synaptic y vuelve a instalr desde ahi mismo todo.

Si acaso, en vez de borrar, cambiales el nombre, por ejemplo, de la siguiente forma:

Asi el sistema no enctrará esas carpteas. (solo con esas tres vale, las otras no las toques, no es necesario).

Edito:
Vaya contestaste mientras escribia esto! xD
Me alegro que lo hayas solucionado... ya sabes para la proxima, make uninstall en vez de borrar xD

Si te faltara alguna libreria o archivo tras esto, mira el error que te da el sistema al ejecutar el programa desde una consola, y luego utiliza

Este comando te dirá que paquete contiene el archivo en cuestion.

Gracias, no recordaba ese comando....