Prueba a instalar el driver de esta manera más simple.

Instalas los headers de tu núcleo (linux-headers-2.6.....) y el paquete nvidia-kernel-dkms

Este sistema hace que se recompilen los drivers automágicamente con cada cambio de kernel. Yo antes usaba m-a pero me parece más limpio y eficaz este sistema.

Pd: estoy en wheezy con driver de nvidia y no me pasa este problema

PD2: Esta mañana vi que no me entraba correctamente en el núcleo 2.6.38, el problema era que no estaban instalados los headers correspondientes al núcleo 2.6.38. Ha sido instalar los headers y automáticamente se me ha creado el módulo de nvidia para este núcleo. Al reiniciar todo va como la seda.

estoy con el kernel 2.6.38-2-686-bigmem.
ya probe de todo y me pasa los mismo con el driver privativo.

Sería un poco extraño que el problema viniese por un driver siendo un problema tan concreto en una aplicación tan concreta.

Uso el kernel amd64 y composite activado en gnome.
¿Has probado a instalar los drivers como te he comentado?

bueno y este problema sucede tambien en el laptop de un amigo tenemos el mismo problema creo que es un bug del driver

Ahora mismo no puedo probar el error, esta mañana he estado 10 minutos con la configuración que te comentaba y no he notado nada extraño.
Puedes confirmar si es un bug reportado buscando en google. Tampoco es raro que wheezy tenga bugs en estos momentos, es la versión de testing y hace poco que ha salido.

realize la instalacion de nvidia-kernel-dkms y el problema sigue :(

Hola amigos, soy reciente en este foro, será mi primera pequeña aportación, espero que sirba.

1. lspci | grep VGA ← esto para verificar si realmente el id de tu targeta es el que figura en el xorg

1. lspci -v -s `lspci | awk '/VGA/{print $1}'` ← este para ver si está usando el driver y tambien para asegurarnos de que nouveau no interfiere

Pegalo en pastebin si te parece para que podamos verlo.
Un saludo desde Sevilla.

Por cierto, tienes dos monitores?

Hola estos son los resultados:

lspci | grep VGA
01:00.0 VGA compatible controller: nVidia Corporation GT200 [GeForce GTX 260] (rev a1)

lspci -v -s `lspci | awk '/VGA/{print $1}'`
01:00.0 VGA compatible controller: nVidia Corporation GT200 [GeForce GTX 260] (rev a1) (prog-if 00 [VGA controller])
Subsystem: XFX Pine Group Inc. Device 2391
Flags: bus master, fast devsel, latency 0, IRQ 16
Memory at fa000000 (32-bit, non-prefetchable) [size=16M]
Memory at d0000000 (64-bit, prefetchable) [size=256M]
Memory at f8000000 (64-bit, non-prefetchable) [size=32M]
I/O ports at cc00 [size=128]
Expansion ROM at fbb80000 [disabled] [size=512K]
Capabilities: [60] Power Management version 3
Capabilities: [68] MSI: Enable- Count=1/1 Maskable- 64bit+
Capabilities: [78] Express Endpoint, MSI 00
Capabilities: [100] Virtual Channel
Capabilities: [128] Power Budgeting <?>
Capabilities: [600] Vendor Specific Information: ID=0001 Rev=1 Len=024 <?>
Kernel driver in use: nvidia

si trabajo con dos monitores. y saludos desde bogota colombia ;)

Por lo que veo la id de tu targeta en el xorg no coincide con la salida.
En el xorg tienes BusID "PCI:1:0:0" cuando deberia ser BusID "PCI:01:00:0" , en fin
aunque no se solocione.. pero arreglalo a ver, ah! para ambos monitores.
Por lo demas... el driver esta bien.

problema con nvidia glx 260 debes cambiar a la versión 270... si buscaras un poco en el buscador veriás lo siguiente:
http://www.esdebian.org/foro/46094/actualizacion-drivers-privativos-nvid...
te aconsejo que lo leas completo... Y al final yo les mostré como realizar la instalación... no puse en la wiki porque se supone que en poco tiempo arreglarán el problema, pero en fin...